Dans les aquariums, les déchets naturels de nos poissons (urine, défécation) et le surplus de nourriture se transforment en ammoniaque, qui à forte dose est toxique. L'objectif de la filtration est d'éliminer cette ammoniaque, ce qui évite des renouvellements d'eau importants et fréquents.

En fait, l'objectif est de transformer cet ammoniaque en substances moins toxiques (nitrite/ nitrate) grâce aux bactéries. Le changement d'eau intervient seulement à ce moment pour diminuer le taux de nitrite/ nitrate.

Il existe 4 sortes de filtration :
    La filtration mécanique
    La filtration biologique
    La filtration chimique
    La stérilisation

Pour mettre en oeuvre ces types de filtration, il existe de nombreux procédés : Filtres à décantation, Filtres sous sable, Filtres intérieurs et extérieurs, etc...